Peptidsyntese refererer til teknikken til kemisk at forbinde aminosyrer i en specifik sekvens for at danne en polypeptidkæde. Den fremherskende metode, der anvendes, er fastfasesyntese, en teknik, der blev udviklet af Bruce Merrifield i 1963, for hvilken han blev tildelt Nobelprisen i kemi i 1984. Det underliggende princip involverer forankring af carboxylterminalen af den første aminosyre til en uopløselig harpiks; efterfølgende aminosyrer tilføjes derefter sekventielt fra C-terminalen mod N-terminalen gennem en gentagen cyklus af afbeskyttelses-, aktiverings- og koblingstrin, som kulminerer i spaltningen af målpeptidet fra harpiksen.
Denne metode forenkler oprensningsprocessen og er let modtagelig for automatisering og etablerer sig derved som en standardteknik til syntese af korte-til-mellemlange-peptider. Peptidsyntese har betydelig praktisk værdi på tværs af forskellige områder, herunder farmaceutisk forskning og udvikling, undersøgelse af biologisk aktivitet og vaccinedesign.